يهدف مرصد الشرق الأوسط إلى تحليل الفرص والتحديات على مختلف الأصعدة الجيوسياسية والاقتصادية، وما تحمله من تساؤلات، مع محاولة إيجاد إجابات علمية وموضوعية لها.

يحاول المرصد الاجابة على إشكاليات منطقة الشرق الأوسط السياسية والاقتصادية من خلال نشر المقالات والأوراق البحثية وإعداد الأبحاث والإحصاءات والدراسات الخاصة، فيحاول من خلالها التأثير إيجاباً في فهم ما يدور في الشرق الأوسط والعالم من قضايا، مع مراعاة نواحي التحليل والنقد والاستشراف الملتزمة بالضوابط الصارمة للبحث الجاد والرصين.

كما يسعى المرصد إلى بناء شبكة علاقات وشراكات قوية مع مختلف المراكز البحثية العالمية والمنظمات والهيئات الدولية الحكومية وغير الحكومية، والاستفادة من الخبرات البحثية والأكاديمية الدولية، بما يعزز دوره على المستويين الإقليمي والعالمي، من خلال تنظيم الفعاليات العلمية المختلفة من محاضرات، ومؤتمرات، وندوات، وحلقات نقاشية.